Русские ученые представили метод, который выявляет раковые мутации

Такие белки с заменами аминокислот могут привести к развитию раковой опухоли.

Измерив вес белковых клеток, которые подверглись мутационным процессам в результате рака, ученые узнали, что он незначительно отличается от веса здоровых клеток. Используя новый подход к протеогеномному анализу с применением расширенной базы данных, ученые обнаружили в клетках HEK-293 113 неповторимых вариантных последовательностей пептидов, относившихся к экзонным областям 103 генов.

Русские ученые создали метод, который может сравнивать масс-спектрометрические результаты различных исследовательских групп и находить белковые мутации, связанные с злокачественным процессом. В дальнейшем масс-спектроскопический анализ будет содействовать обнаружению мутировавших клеток. Для анализа и поиска мутантных белков программа сравнивает приобретенные результаты масс-спектрометрии с платформой данных белков всего организма. Ученые добавили в «словарь» белков расстановки, которые отличаются от начальных на одну либо несколько аминокислот, что позволило обнаруживать «неправильные» белки.

Протеогеномика — область, к которой относится новое исследование, сочетает внутри себя методы геномики и протеомики (науки, изучающей совокупность белков клетки либо целого организма). Эффективность подхода ученые показали на клеточной линии HEK-293, полученной из почки человеческого зародыша.

«Наш подход может в дальнейшем использоваться для поиска ассоциированных с раком мутаций на основе протеомных данных. Это, в свою очередь, несомненно поможет в изучении белкового состава опухолей и разработке препаратов, „нацеленных“ на мутантные белки, производимые в опухолевых клетках», — заявляет один из управляющих проекта, заведующий лабораторией физико-химических методов исследования структуры веществ ИНЭПХФ РАН Михаил Горшков.

В качестве демонстрации команда Горшкова изучила набор мутантных белков в линии «бессмертных» раковых клеток HEK-293, которую часто используют для проведения разнообразных исследований в молекулярной биологии и которая накопила внутри себя большое количество мутаций. Ученые полагаются, что новый подход несомненно поможет изучить белковый состав опухолей и создать препараты, нацеленные на мутантные белки опухолевых клеток.